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冥酱の后宫
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开开の主人様です~です~
频道主
2025-10-29
ggplot2绘图 报错 Removed 1 row containing missing values or values outside the scale range 这种报错很大原因可能是x和y轴上下界导致的问题 例如我这次遇到的堆叠图绘制始终绘制不出来的问题。 ai一直觉得是数据处理的问题,但实际上数据处理本身没有问题,有问题的是计算机本身的限制 浮点数精度: 当计算机处理小数(比如我们的 proportion)时,它无法精确地存储所有值。例如,1/3 存储为
0.333333...
。 求和误差: 当我们把一个样本中所有细胞类型的 proportion 加起来时,由于这些微小的存储误差累积,总和可能不是精确的 1.0,而是一个极其接近的数字,比如 1.00000000000001 或 0.9999999999999999。 百分比溢出: 当我们将这个略大于1的数字乘以100,结果就变成了 100.000000000001。 严格的坐标轴限制: scale_y_continuous(limits = c(0, 100)) 是一个严格的“守门员”。任何严格大于100的数据点,都会被它视为“界外”(out of bounds),并被替换为 NA。 渲染失败: 对于 geom_area 和 geom_col 的堆叠图,如果最顶部的那个数据点的 y 值变成了 NA,ggplot2 就无法完成多边形的闭合或矩形的绘制,导致了我们看到的渲染缺失和锯齿。 部分参考连接:
https://zhuanlan.zhihu.com/p/697848548
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开开の主人様です~です~
频道主
2025-09-24
另一种配置环境的方法: 在 conda 里导出 环境配置文件 非常方便,这样别人可以一键复现你当前的 R 环境。 1. 导出 conda 环境 假设你的环境叫 r_env: bash conda activate r_env conda env export >
r_env.yml
这样就会生成一个
r_env.yml
文件,里面包含: R 版本(r-base=
4.x.x
) 你通过 conda 装的所有 R 包和 Python 包 依赖来源渠道(channel,比如 conda-forge) 别人拿到
r_env.yml
后,可以这样恢复环境: bash conda env create -f
r_env.yml
2. 导出 R 包(在 R 内部) 如果你想只导出 R 包信息(不依赖 conda),在 R 里运行: R installed.packages()[, c("Package", "Version")] 或者更简洁地写: R write.csv(installed.packages()[, c("Package", "Version")], "
R_packages.csv
") 这样会生成一个
R_packages.csv
,别人可以用来参考并安装: R pkgs <- read.csv("
R_packages.csv
") install.packages(as.character(pkgs$Package)) 3. 推荐做法 科研复现 → 导出
r_env.yml
(保证 conda 里 R 版本 + 包依赖一致)。 共享给纯 R 用户 → 额外导出
R_packages.csv
(只包含 R 包,适合 CRAN 用户)。 要不要我帮你写一个小脚本,同时导出 conda 环境 (YAML) + R 包列表 (CSV),方便你一键分享?
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开开の主人様です~です~
频道主
2025-09-24
https://zhuanlan.zhihu.com/p/438451509
解决R包“had non-zero exit status”安装报错
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开开の主人様です~です~
频道主
2025-08-13
ai半天解决不了,知乎解决了9999
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开开の主人様です~です~
频道主
2024-12-05
scamble siRNA 指与所使用的特异性siRNA序列的核苷酸成份相同,但打乱了的,即碱基顺序不同的RNA。 同时,设计scrambled siRNA时还要通过BLAST进行比对,防止其与目的靶细胞基因组中的其他基因有同源性,这样才能作为阴形对照。 与目标基因有最多不超过10 bp长度的匹配
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开开の主人様です~です~
频道主
2024-11-29
神医
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开开の主人様です~です~
频道主
2024-11-29
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开开の主人様です~です~
频道主
2024-11-29
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开开の主人様です~です~
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2024-11-27
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